Met systeemdenken leren ontwerpers, engineers en managers hoe onderdelen op elkaar inwerken, niet hoe ze onafhankelijk presteren. Als er wijzigingen worden aangebracht binnen een deel van het systeem, kan dit van invloed zijn op andere onderdelen. Deze wijzigingen kunnen nieuwe problemen veroorzaken die erger zijn dan de aanvankelijk behandelde problemen. Daarom wordt systeemdenken gebruikt om het hele systeem in overweging te nemen bij het ontwerpen of verbeteren van een heel systeem of een deel van het systeem.
Leijenaar Solutions hanteert systeemdenken voor systeemarchitectuur, mechatronisch ontwerp, probleemoplossing, strategieontwikkeling en constraint management.